全書共四卷，分為前、後二集，前集論述傷寒及傷寒諸證、六經分屬病證、五臟和命門脈證，並附治病合用藥方165首，包括湯類、飲煎類、散類、丸類等。後集分述內科雜病，兼及外科、婦科、兒科、目齒等病證證治，是一部綜合性著作。程氏鑽研《傷寒雜病論》頗有心得，臨床診治均宗仲景之旨，提出“雜病准傷寒治法”的觀點：認為古人之方雖為一病而設，亦可數處兼用。如：四君子湯可以補氣，可以調氣，可以降氣，凡涉於氣證者皆可用之；四物湯可以補血，可以調血，又可止血，凡涉及血證者皆可用之。

又宗前賢“肝腎同歸於一治”之說，闡述“心肺亦當同歸一治”之論，均可開惠後學。程氏深究脈學，多有發揮，嘗謂：“治病之要，不過切脈辨證處治三者而已，三者之中，又以切脈為先。”故將五臟及命門分為六圖，各以臟腑附之，俱分浮中沉三候，浮沉之中又分遲數平，遲數之中又分虛實冷熱，舉其要而括為圖說，各具其證與方藥。所錄皆常用之方，每可互通，且頗多藏之不予示人的秘傳效方，可資臨床參考和借鑒。

前集
雜病准傷寒治法
傷寒傷風辨證
傷寒證
傷風證
傷寒見風傷風見寒
傷寒傷風傳至肌肉
傳經
傳少陽
傳陽明經
傳三陰經
結胸 以下皆壞症也
痞
蓄血
發黃
發斑 陰證附條下
疰病 陰痓附條下
傷寒治法
傷寒壞病變證
傷風 附
辨傷寒潮熱形證死訣
辨外證九候死訣
入患門察形證訣
六經分屬病證
治病合用藥方
後集
中風 一
中寒 二
中暑 三
中濕 四
感冒 五
內傷 六
鬱證 七
痰飲 八
咳嗽 九
瘧證 十
泄瀉 十一
痢 十二
嘔吐噁心 十三
吞酸 十四
嘈雜暖氣 十五
梅核氣 十六
水腫臌脹 十七
虛損 十八
勞怯 十九
頭痛 二十
心痛 二十一 即胃脘痛
腹痛 二十二
腰痛 二十三
氣證 二十四