本書主要介紹蛋白質工程的基本內容，兼顧學科發展動態，着重介紹蛋白質的結構基礎、蛋白質分子設計、蛋白質物理化學、蛋白質修飾與表達、蛋白質結構測定等，同時還對蛋白質的分離純化、蛋白質生物信息學、蛋白質技術、蛋白質組學等做了介紹。

第二版前言第一版前言1緒論1.1蛋白質工程的起源1.2蛋白質工程的研究內容1.2.1蛋白質的基礎知識1.2.2蛋白質的物質准備1.2.3蛋白質的研究方法1.2.4蛋白質的改造應用1.3蛋白質工程與其他學科1.4蛋白質工程的應用領域思考題主要參考文獻2蛋白質的結構基礎2.1蛋白質的功能及其應用2.1.1蛋白質的生物學功能2.1.2蛋白質的應用2.2蛋白質、氨基酸與多肽鏈2.2.1氨基酸2.2.2蛋白質中常見氨基酸的分類2.2.3肽2.3蛋白質的結構2.3.1蛋白質的一級結構2.3.2蛋白質的空間結構2.4蛋白質結構與功能的關系2.4.1蛋白質一級結構與功能的關系2.4.2蛋白質的空間結構與功能的關系2.4.3蛋白質的變性與復性思考題主要參考文獻3蛋白質的表達3.1蛋白質的原核表達3.1.1大腸桿菌表達系統3.1.2枯草芽孢桿菌表達系統3.2蛋白質的真核表達3.2.1酵母表達系統3.2.2昆蟲桿狀病毒表達系統3.2.3哺乳動物細胞表達系統思考題主要參考文獻4蛋白質的修飾4.1蛋白質的化學修飾4.1.1蛋白質側鏈基團的化學修飾4.1.2蛋白質的位點專一性修飾4.1.3蛋白質的聚乙二醇（PEG）修飾4.1.4蛋白質的化學交聯和化學偶聯4.2蛋白質的分子生物學改造4.2.1基因突變技術4.2.2基因融合技術4.2.3摻入非天然氨基酸思考題主要參考文獻5蛋白質的物理化學性質5.1蛋白質熱力學函數與蛋白質構象平衡5.1.1描述蛋白質體系的主要熱力學函數5.1.2蛋白質構象與熱運動5.1.3維持蛋白質構象的作用力5.2突變與折疊5.2.1突變與熱穩定性5.2.2蛋白質折疊5.3蛋白質折疊熱力學和動力學5.3.1蛋白質折疊的熱力學研究5.3.2蛋白質折疊的動力學研究5.3.3蛋白質構象研究方法思考題主要參考文獻6蛋白質的結構解析6.1利用X射線晶體衍射技術解析蛋白質結構6.1.1X射線晶體衍射技術的發展和基本原理6.1.2蛋白質結晶方法6.1.3X射線晶體衍射解析蛋白質結構的基本方法6.2核磁共振波譜法解析蛋白質結構6.2.1有關核磁共振波譜法的基礎理論6.2.2多維核磁共振技術6.2.3NMR測定蛋白質空間結構的步驟和關鍵環節6.2.4核磁技術的發展與應用」6.3蛋白質結構研究的其他方法6.3.1電鏡三維重構技術6.3.2質譜技術6.3.3熒光共振能量轉移技術思考題主要參考文獻7蛋白質結構預測7.1生物信息學與蛋白質工程7.1.1生物信息學概述7.1.2生物信息學與蛋白質工程7.1.3生物信息學與蛋白質組學7.2蛋白質工程常用數據庫7.2.1核酸數據庫7.2.2蛋白質數據庫7.3蛋白質結構預測7.3.1蛋白質序列比對7.3.2蛋白質基本性質分析7.3.3蛋白質二級結構預測7.3.4蛋白質結構預測實例思考題主要參考文獻8蛋白質分子設計8.1概述8.1.1蛋白質分子設計的基本概念8.1.2蛋白質分子設計的基本流程8.2蛋白質分子設計的類型8.2.1基於天然蛋白質結構的分子設計8.2.2全新蛋白質的分子設計8.3蛋白質分子設計中的技術方法8.3.1同源建模8.3.2蛋白質二級結構的預測8.3.3分子動力學模擬8.3.4基因工程構建設計蛋白質8.4蛋白質分子設計的應用及發展趨勢12.4.2明膠12.4.3絲素蛋白12.4.4彈性蛋白12.4.5羊毛角蛋白12.4.6植物蛋白12.5在其他領域中的應用12.5.1基礎理論研究12.5.2其他思考題主要參考文獻