「海洋X檔案」是海生館嚐試將科學與美學結合的一個特展。以往的X光攝影常用在海洋生物的研究上，包括如海洋生物的分類、成長監測、耳石的定位和珊瑚的年齡測定等。這些科學資料在經過巧手轉化，將原本冷冰冰的影像加入了時尚的炫彩效果，竟搖身一變成為了吸引大眾目光的焦點；特別值得一提的是館方運用了深海情境般的「黑箱」展示手法，一方面藉由神祕感的營造來引起民眾的好奇心，另一方面也透過小故事的導引，讓在欣賞這些美麗的影像同時，也增添了海洋知識的內容，這樣一來更能將海洋生物的知識烙印在腦海中。